認定NPO法人等に対してその認定NPO法人等が行う特定非営利活動に係る事業に関連する寄附金を支出した場合には、一般の寄附金に係る損金算入限度額とは別枠で「損金算入限度額の計算」により計算した特別損金算入限度額の範囲内で損金の額に算入されます。
詳細は以下よりご確認ください。

https://www.nta.go.jp/taxes/shiraberu/taxanswer/hojin/5284.htm